In der gegenwärtigen Debatte (siehe Literaturliste und Weblinks) um die Rolle der Bekennenden Kirche in Schleswig-Holstein werden immer wieder vier Themen kontrovers diskutiert:

• Die Frage, welche Bedeutung das Alte Testament für den christlichen Glauben hat.
• Die Frage der Zugehörigkeit von Christen jüdischer Herkunft zur Landeskirche und der Integrität ihrer Taufe.
• Die Frage des angemessenen Umgangs mit Versäumnissen und Schuld angesichts des nationalsozialistischen Unrechts, besonders gegen die Juden, und das Problem der Vergebung von (vielleicht auch: unvergebbarer) Schuld.
• Die Frage, ob der während der Nazi-Zeit offen zutage getretene Antijudaismus eine Spätfolge der judenkritischen Äußerungen Luthers aus seinen letzten Lebensjahren ist.

Literaturhinweise:

• Flüchtlingsdienst des ÖRK (Hrsg.), Die Evangelische Kirche in Deutschland und die Judenfrage. Ausgewählte Dokumente aus den Jahren des Kirchenkampfes 1933 bis 1943, Genf: Verlag Oikumene 1945. (Einleitung: geschichtliche Voraussetzungen)
• Hermann Albert Hesse, Die Judenfrage in der Verkündigung heute, Stuttgart 1948.
• Gerhard Jasper, Vom Sinn der Wiedergutmachung an Israel, Gütersloh: Kirche und Mann 1954. (siehe: Luxemburger Abkommen)
• Wilhelm Niemöller, Kirche und Israel. Ein Beitrag aus dem Jahre 1939, in: Evangelische Theologie 24 (1957) 468-478.
• Otto L. Elias, Der evangelische Kirchenkampf und die Judenfrage, in: Informationsblatt für die Gemeinden in den niedersächsischen lutherischen Landeskirchen 10 (1961) 213-220.
• Karl Kupisch, Die Bekennende Kirche und die Judenfrage (1961), in: ders., Durch den Zaun der Geschichte. Beobachtungen und Erkenntnisse, Berlin: Lettner 1964, S. 371-398.
• Kurt Meier, Kirche und Judentum. Die Haltung der evangelischen Kirche zur Judenpolitik des Dritten Reiches, Halle (Saale): VEB Max Niemeyer 1968.
• John S. Conway, Das Versagen gegenüber den Juden, in: ders., Die nationalsozialistische Kirchenpolitik 1933-1945. Ihre Ziele, Widersprüche und Fehlschläge, München: Chr. Kaiser 1969, S. 275-281.
• Wolfgang Gerlach, Als die Zeugen schwiegen. Bekennende Kirche und die Juden (Schriften zu Kirche und Israel, Band 10), Berlin: Institut Kirche und Judentum 1987; 2., bearbeitete und ergänzte Auflage 1993 (= Diss. Hamburg 1970).
• Rolf Rendtorff/ Hans Hermann Henrix (Hrsg.), Die Kirchen und das Judentum. Dokumente von 1945-1985, München 1976.
• Johannes Schlingensiepen, Widerstand und verborgene Schuld. Erinnerungen an den Kampf der Bekennenden Kirche, Wuppertal: Jugenddienst 1976, 2. erw. Auflage 1977.
• Hans Prolingheuer, Wir sind in die Irre gegangen. Die Schuld der Kirche unterm Hakenkreuz, nach dem Bekenntnis des "Darmstädter Wortes" von 1947, Köln: Pahl-Rugenstein 1987.
• Christine-Ruth Müller, Dietrich Bonhoeffers Kampf gegen die nationalsozialistische Verfolgung und Vernichtung der Juden. Bonhoeffers Haltung zur Judenfrage im Vergleich mit Stellungnahmen aus der evangelischen Kirche und Kreisen des deutschen Widerstandes, München: Chr. Kaiser 1990.
• Marikje Smid, Deutscher Protestantismus und Judentum 1932/1933, München: Chr. Kaiser 1990.
• Eberhard Röhm/ Jörg Thierfelder, Juden - Christen - Deutsche, Bd. 1-4.2, Stuttgart: Calwer 1990-2006.
• Heinz Eduard Tödt, Die Verdrängung der jüdischen Mitbürger aus der Reichsbürgerschaft und aus Wirtschaft, Gesellschaft und Kirche, in: ders., Komplizen, Opfer und Gegner des Hitlerregimes. Zur "inneren Geschichte" von protestantischer Theologie und Kirche im "Dritten Reich". Hrsg. von Jörg Dinger und Dirk Schulz, Gütersloh: Chr. Kaiser 1997 [postum].
• Axel Töllner, Eine Frage der Rasse? Die Evangelisch-Lutherische Kirche in Bayern, der Arierparagraf und die bayerischen Pfarrerfamilien mit jüdischen Vorfahren im "Dritten Reich", Stuttgart: Kohlhammer 2007.
• Manfred Gailus (Hrsg.), Kirchliche Amtshilfe. Die Kirche und die Judenverfolgung im "Dritten Reich", Göttingen: Vandenhoeck & Ruprecht 2008.
• Manfred Gailus, Mir aber zerriss es das Herz. Der stille Widerstand der Elisabeth Schmitz, Göttingen: Vandenhoeck & Ruprecht 2010, 2. Aufl. 2011.
• Hartmut Ludwig/ Eberhard Röhm/ Jörg Thierfelder (Hrsg.), Evangelisch getauft - als "Juden" verfolgt. Theologen jüdischer Herkunft in der Zeit des Nationalsozialismus. Ein Gedenkbuch, Stuttgart: Calwer 2014.
• Sibylle Biermann-Rau, Elisabeth Schmitz. Wie sich die Protestantin für Juden einsetzte, als ihre Kirche schwieg, Hamburg 2017.